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上级不同。省直事业单位的上级是政府的一个部门，比如省质监局下属的产品质量检验所就是省直事业单位。省属事业单位则是独立的一个事业单位，市直事业单位道理和省直的一样；

2、工资下发单位不同。

省级单位是省政府或者各厅下属的，由省财政发工资；市级事业单位是市政府或者各局下属的，由市财政发工资；

3、待遇不同。

待遇方面，不一定省级比市级好，主要看单位有无创收以及上级的重视程度；广东省属事业单位考什么事业单广东省属事业单位考什么位改革，市级的比较有可能波及。